教宗方济各6月21日前往瑞士日内瓦，在世界基督教协会（WCC）成立70周年的机会上进行这次大公运动朝圣之旅。继保禄六世和若望保禄二世之後，方济各是第三位莅临这座瑞士城市的教宗。他於出访前夕，6月20日下午前往罗马圣母大殿，在罗马人民救援之母圣像前献上祈祷。

6月21日上午，教宗从罗马搭乘专机前往日内瓦。在去程的飞机上，他问候随行记者，感谢他们在这次牧灵访问期间的服务，并强调此行是「怀着合一的心愿迈向合一的旅程」。

当天上午10点多，教宗专机降落在日内瓦机场，教宗方济各受到热烈欢迎：瑞士联邦主席贝尔塞（Alain Berset）和两名瑞士卫队退役成员在登机楼梯下方迎接他，穿着传统服饰的孩童们向他献上花束。介绍了在场的代表团後，教宗在机场贵宾厅与贝尔塞主席进行私人会晤，然後互赠礼物。教宗赠送给贝尔塞一张复制画，描绘的是瑞士卫队首任指挥官冯‧希勒嫩（Kaspar von Silenen）与教宗朱利奥二世（Julius II）於1507年3月凯旋返回罗马城的景象。

随後，教宗乘车前往世界基督教协会总部、日内瓦大公运动中心，参加大公祈祷活动。这是他当天密集行程中的首项活动。