「长久以来，我一直渴望前往日本传教，耶稣会向来在那里推展极为重要的工作。」2010年出版的《耶稣会士》一书，记载了时为贝尔格里奥枢机、现今教宗方济各的这番话。

自1549年圣方济各‧沙勿略踏上日本土地以后，这个东亚国家格外吸引耶稣会士。首次福传后的5个世纪，耶稣会特别关注大和民族及文化。这份关切之情在这几十年来因著近两任的耶稣会总会长日益增强，因为两位总会长雅鲁培（Pedro Arrupe）神父和倪胜民（Adolfo Nicolás）神父都曾在日本生活多年。更何况，耶稣会士皮陶（Giuseppe Pittau）神父在日本和西方文化交流上扮演了重要角色。

教宗方济各本人对日本的独特关注也是有迹可循的。2013年4月17日，贝尔格里奥刚展开教宗牧职没多久，便在圣玛尔大之家的清晨弥撒讲道中提及日本教会的见证：即使是在16至17世纪的教难时期，日本天主教徒依然活跃。令教宗方济各最为感动的是平信徒的力量：他们协助教会安然度过风暴。传教士一度被逐出日本，当他们返回那里时，竟发现「所有的团体都井然有序，每个人都领了洗，学习了要理，并且在教会内结婚」。

两年后，教宗方济各在接见日本的述职主教时，再次进行了以上的反思。在那次机会上，他提到日本天主教会传奇的两大支柱：一个是在圣方济各‧沙勿略之后的传教士，「他们为服务福音和日本人民而奉献生命」；另一个是教宗说的「隐藏踪迹的基督徒」。

日本教会经历了混乱时期，领受了丰沛恩典。她提醒我们，基督徒的天性就是传教。传教的教会通过自身的吸引力来传扬福音。教宗方济各从牧职之初就宣讲并见证这一点。在贝尔格里奥的心目中日本具备撒播福音小种子的沃土。